中国科学院数学与系统科学研究院成立于1998年12月， 是由中科院数学研究所（建于1952年）、应用数学研究所（建于1979年）、系统科学研究所（建于1979年）及计算数学与科学工程计算研究所（建于1995年）等四个研究所整合而成。首任院长是杨乐院士，现任院长是周向宇研究员。
研究院简介
研究院是一个综合性的国立学术研究机构，覆盖了数学与系统科学的主要研究方向。研究院新时期的办院方针是：在数学与系统科学领域，面向国际发展前沿，面向国家战略需求，做出突破性、原创性和关键性的重大理论成果与应用成果，造就具有国际重要影响的学术带头人和一批杰出人才。研究院的
发展目标是：在数学与系统科学领域内，成为国际上有重要影响的研究中心、培养和造就高级研究人才的著名中心、国民经济和国防建设有关问题研究和咨询的重要中心。
研究院除了下属的四个研究所以外，还有科学与工程计算国家重点实验室、中科院管理决策与信息系统重点实验室、中科院系统控制重点实验室、中科院数学机械化重点实验室， 以及中科院晨兴数学中心和中科院预测科学研究中心等。2000年以来根据学科发展和实际需求, 又新成立了若干建立在交叉学科基础上的 研究中心。
院徽
中科院数学与系统科学研究院的院徽是中国古代数学家赵爽给出的勾股定理的证明.
贡献
五十年来，研究院荟萃了我国一大批著名数学家和系统科学家。四个研究所的科研人员在理论研究和实际应用方面，为我国数学和系统科学的发展以及国民经济和国防建设做出了重要的贡献，获得各种科技奖励400余项，其中包括首届国家最高科学技术奖(吴文俊)，4项国家自然科学奖一等奖(华罗庚“典型域上的多元复变数函数论”， 吴文俊“示性类与示嵌类的研究”，陈景润和王元等“哥德巴赫猜想研究”，冯康等“哈密尔顿系统的辛几何算法”)，15项国家自然科学二等奖以及一些重要的国际学术奖励。 不少重要的应用成果受到中央领导和实际部门的充分肯定，显示了数学和系统科学理论在国民经济主战场的作用。
研究院规模
研究院科研队伍实力雄厚，现有职工300余人，其中科研人员200余人，包括中国科学院院士15人，中国工程院院士2人，第三世界科学院院士5人，中科院“百人计划”入选者22人，国家杰出青年基金获得者A类32人，B类15人，C类1人。现有在学研究生401人(硕士研究生170人，博士研究生231人)。博士后46人。研究院下属的四个研究所是我国最早被批准具有硕士、博士学位授予权的单位之一，是首批国家批准的博士后流动站之一。全院12个博士点分布在数学、系统科学、管理科学与工程、计算机科学与技术四个一级学科中。
理念与目标
“数系天地，勤笃求真”是研究院的理念。数学与系统科学来源于自然和实践，同时又服务于自然科学与社会实践，“自然界的奥秘是用数学语言写成的”，数学是理解天地间万物的工具和基础。勤奋、踏实、执著是治学者所应具备的最基本的品质。作为数学与系统科学研究工作者，应当勤思笃行，具有只争朝夕、脚踏实地、甘于寂寞、坚持不懈的工作作风。为了探索和追求科学真理，应当具有敢于挑战困难、敢为天下先的自信心；具有不怕失败、不怕非议、不怕磨难的科学精神；具有理论“顶天”、应用“立地”的奋斗目标。
初创基业
1950年6月，新中国的科学院建立不久，在百废待兴的情形下，着手筹建数学研究所。筹备处设在北京文津街3号，由著名数学家苏步青任筹备处主任，周培源、江泽函、华罗庚、许宝騄任筹备处副主任，田方增任秘书。筹建工作受到中央人民政府的高度重视。1951年1月，政务院批文任命华罗庚为即将成立的数学研究所所长。1952年7月1日数学研究所正式成立，所址设在清华园内，确立了纯粹数学与应用数学协同发展的方针。最早成立的研究小组有数论、微分方程、力学、计算机研制、概率统计、代数、拓扑学等。
1953年上半年，数学研究所共有科研人员32人，其中专任研究员5人。仅在这32人中，后来当选为中国科学院院士的就有17人。
1956年，通过我国十二年科学技术发展远景规划的制定，数学研究所在保障数学各重要方向协调发展的同时，重点发展微分方程、概率统计等与国民经济和国防建设关系密切的分支。同时设立了泛函分析、数理逻辑等研究组，以加强相应理论学科的研究。1957年从法国归来的熊庆来先生负责建立了函数论研究组。同一时期，与力学和计算机研制有关的研究工作则独立出去，另行组建中国科学院力学研究所和计算技术研究所。在十二年科学技术发展远景规划的鼓舞下，数学所迈上了向科学进军的大道。
1956年，我国颁发首届国家自然科学奖。在全部3项一等奖中，数学所获得了2项，即华罗庚的"典型域上的多元复变数函数论"和吴文俊的"示性类与示嵌类的研究"。
这时期数学研究所的所址有了变迁，1957年临时迁往西苑旅社，1958年迁入中关村（现计算技术研究所北楼）。
1961年按学科建立了研究室，包括"四学科"（数论、代数、几何、拓扑），函数论，微分方程，泛函分析，数理逻辑，理论物理，概率统计，以及由力学、数学两所在钱学森、华罗庚、许国志倡导下从事新兴应用学科运筹学的室组合并而成的运筹学研究室。1962年由于国家任务的需要，新建了由关肇直、宋健领导的控制理论研究室。稍后又重设了力学研究室。各项研究工作迅速推进。1961-1965年，是数学所贯彻"出成果、出人才"的方针，相对稳定并酝酿突破的发展时期。
1966年"文革"开始后，研究工作陷入停顿。1972年周恩来总理关于加强基础理论研究的指示使数学研究工作又重新开展起来。1973年陈景润正式发表了他对哥德巴赫猜想的研究；1975年，杨乐、张广厚发表了关于值分布理论的研究。冯康等人于60年代初独立于西方创立的有限元计算方法，在国民经济和国防建设的许多部门获得了广泛的应用。这些代表性的工作向世人展示了数学研究所科研人员在极度艰难的条件下，坚持数学研究而取得的标志性成果。
科学的春天
1976年粉碎"四人帮"以后，特别是1978年全国科学大会的召开，迎来了科学的春天。在尊重知识、尊重人才的氛围下，数学所科研人员努力追赶国际数学前沿，纯粹与应用数学各个领域的工作都得到全面迅速的推进，走上了健康发展的轨道。 1977年，中国科学院成立了以计算数学为主要研究对象的计算中心（1995年改为计算数学与科学工程计算研究所），所址在中关村南四街4号。历任主任（所长）为：冯康、石钟慈、崔俊芝、袁亚湘。1979年底，根据中国科学院决定，部分人员从数学研究所分出成立了系统科学研究所，从事控制理论、运筹管理、统计学、系统工程以及相关数学边缘学科的研究。历任所长为：关肇直、成平、陈翰馥、郭雷。数学研究所部分研究人员与原中国科学院应用数学推广办公室人员合并，组建成立应用数学研究所。历任所长为：华罗庚、吴方、章祥荪、马志明。数学研究所则以基础理论研究为主，兼顾应用数学和计算机科学等其他方向。历任所长为：华罗庚、陆启铿（常务副所长）、王元、杨乐、龙瑞麟、李炳仁（代所长）、王跃飞。四所科研人员既分工，又合作，出现了出成果、出人才的大好形势。1982年，当国家恢复颁发自然科学奖时，四个研究所再度以高水平成果而受到社会瞩目。1991年所址迁入中关村南四街甲1号。
历史的机遇
1998年12月，在中国科学院知识创新工程的推动下，数学研究所、应用数学研究所、系统科学研究所、计算数学与科学工程计算研究所，整合成为数学与系统科学研究院。杨乐任研究院院长，章祥荪任常务副院长。建院以来，进行了一系列重大改革，特别是调整结构，转换机制；凝练学科目标，明确主攻方向；改造园区环境，建设创新文化。各项工作取得了迅速进展和明显成效。知识创新工程给数学和系统科学的发展带来了新的机遇。 数学研究所设有基础数学研究室，非线性分析研究室，几何分析青年研究中心，计算机科学研究室，以及晨兴数学中心。应用数学研究所设有运筹学研究室，概率统计研究室，方程与计算研究室，决策与信息科学研究室。系统科学研究所设有系统控制重点实验室，管理、决策与信息系统重点实验室，统计学研究室，基础数学与应用数学研究室，数学机械化研究中心。计算数学与科学工程计算研究所设有科学与工程计算国家重点实验室。研究院新成立了图论与组合开放实验室，不确定性决策研究中心，信息安全中心。目前正在积极筹备的有动力系统研究中心，金融数学研究中心，生物信息学研究中心等。这些跨学科、反映新增长点的研究中心的建立，符合国家战略需求，有利于促进多学科交叉。 中国数学会、中国运筹学会、中国系统工程学会等挂靠在数学与系统科学研究院。研究院主办14种学术刊物。
研究院荣誉
五十年来，四个研究所的科研人员在理论研究和实际应用方面，为我国数学和系统科学的发展以及国民经济和国防建设做出了重要的贡献，获得各种科技奖励400余项，包括1项国家最高科学技术奖，4项国家自然科学奖一等奖，以及一些重要的国际奖励。一些重要的应用成果受到中央领导和实际部门的充分肯定，也显示了数学理论在国民经济主战场的作用。
In the past 50 years, the scientific personnel of the four institutes has made important contributions to the country's development of mathematics and system sciences as well as the construction in national economy and national defence. They have won more than 400 scientific awards, including one National Top Science and Technology Award, four first-class prizes of the National Natural Science Award, and some important international awards. Some important research achievements in applied sciences have been acknowledged by the central government leaders and relevant divisions of application. This has proved the important role of mathematical theory in the main fronts of the national economy.
江泽民主席向国家最高科学技术奖获得者吴文俊教授颁奖
Chairman Jiang Zemin vested Wu Wenjun the first National Top Science and Technology Award.
国家自然科学奖一等奖：National Natural Science Award (first class):
典型域上的多元复变数函数论（华罗庚，1956）
The theory of functions of several complex variables over classical domains (Hua Luogeng, 1956)
示性类与示嵌类的研究（吴文俊，1956）
Studies on characteristic classes and embedding classes (Wu Wenjun, 1956)
哥德巴赫猜想研究（陈景润、王元、潘承洞，1982）
Studies on the Goldbach conjecture (Chen Jingrun, Wang Yuan, Pan Chengdong, 1982)
哈密尔顿系统的辛几何算法（冯康等，1997）
Symplectic geometric algorithm of Hamiltonian systems (Feng Kang et al., 1997)
国家自然科学奖二等奖：National Natural Science Award (second class):
整函数和亚纯函数的值分布论（杨乐、张广厚，1982）
The theory of value distribution of entire and meromorphic functions (Yang Le, Zhang Guanghou, 1982)
飞行器弹性振动控制理论研究（宋健、关肇直等，1982）
Control theory of elastic vibration of flying equipments (Song Jian, Guan Zhaozhi et al., 1982)
有限元方法（冯康、黄鸿慈等，1982）
The finite element method (Feng Kang, Huang Hongci et al., 1982)
流体弹性模型及其在核爆与穿甲方面应用（主要参加者李荫藩，1982）
Fluid elastic models and applications to nuclear explosion and armour-piercing (Li Yinfan as a main participant, 1982)
复几何与相关问题（钟家庆，1987）
Complex geometry and related problems (Zhong Jiaqing, 1987)
补偿列紧原理与等熵气动力学方程组（丁夏畦等，1989）
Compensated compactness principle and the system of equations of isentropic gas dynamics (Ding Xiaqi et al., 1989)
量子场论大范围性质的研究（主要参加者王世坤，1989）
Studies on the global properties of quantum field theory (Wang Shikun as a main participant, 1989)
非线性微分方程及其在几何中的应用（丁伟岳，1993）
Non-linear differential equations and applications to geometry (Ding Weiyue, 1993)
狄氏型与随机分析（马志明、严加安，1993）
Dirichlet forms and stochastic analysis (Ma Zhiming, Yan Jiaan, 1995)
关于斯坦纳树的研究（堵丁柱，1995）
Studies on the Stener tree (Du Dingzhu, 1995)
几何定理机器证明理论与算法的新进展（主要参加者高小山，1997）
New development of theory and algorithms of mechanization of geometric theorem proving (Gao Xiaoshan as a main participant, 1997)
国家自然科学奖三等奖：National Natural Science Award (third class):
迁移算子占优本征值研究（阳名珠、朱广田，1982）
Studies on dominant eigenvalues of transport operators (Yang Mingzhu, Zhu Guangtian, 1982)
初边值问题差分方法及绕流（朱幼兰等，1982）
Difference method of initial boundary value problems and rotational flow (Zhu Youlan et al., 1982)
典型群的同构理论（万哲先等，1987）
Isomorphism theory of classical groups (Wan Zhexian et al., 1987)
典型流形与典型域（陆启铿，1987）
Classical manifolds and classical domains (Lu Qikeng, 1987)
最优化的理论及算法（越民义、吴方、韩继业等，1987）
Optimization theory and algorithms (Yue Minyi, Wu Fang, Han Jiye et al., 1987)
动态系统的辨识与适应控制（陈翰馥、郭雷，1987）
Identification and adaptive control for dynamical systems (Chen Hanfu, Guo Lei, 1987)
有限元理论及方法（石钟慈，1989）
The finite element theory and methods (Shi Zhongci, 1989)
自适应估计与控制的基础理论（郭雷、陈翰馥，1997）
Fundamental theory of adaptive estimation and control (Guo Lei, Chen Hanfu, 1997)
参数摄动控制系统的鲁棒分析与综合（主要参加者王恩平，1999）
Robust analysis and synthesis of control systems of parameter perturbation (Wang Enping as a main participant, 1999)
国家科技进步奖特等奖：National Science & Technology Progress Award (special class):
尖兵一号通用型卫星及东方红一号卫星（主要参加者关肇直，1985）
The general-purpose satellite Jianbing No.1 and the satellite Dongfanghong No.1 (Guan Zhaozhi as a main participant, 1985)
国家科技进步奖一等奖：National Science & Technology Progress Award (first class):
人口系统定量研究及其应用（主要参加者朱广田，1987）
Quantitative studies of population systems and applications (Zhu Guangtian as a main participant, 1987)
攀钢提钒工艺参数的系统优化----完善提高提钒工艺技术（主要参加者徐伟宣、徐中玲，1988）
Systematic optimization of technological parameters of extracting vanadium (Xu Weixuan, Xu Zhongling as main participants, 1988)
国家科技进步奖二等奖：National Science & Technology Progress Award (second class):
建筑结构统一设计标准（安全度研究）（主要参加者刘源张，1986）
Unified design standards of building structure (Liu Yuanzhang as a main participant, 1986)
地震勘探数值方法（冯康、张关泉等，1987）
Numerical methods of seismic prospecting (Feng Kang, Zhang Guanquan et al., 1987)
黄淮海平原农业时空开发配置模型（主要参加者王毓云，1988）
Disposition model of agricultural time and space developing of Huang-Huai-Hai Plain (Wang Yuyun as a main participant, 1988)
天马通用型集成式专家系统开发环境（陆汝钤，1993）
"Heaven Steed" --- A general-purpose and integrated expert system development environment (Lu Ruqian, 1993)
有限元程序自动生成系统（梁国平，1995）
Automatically generating system of finite element programs (Liang Guoping, 1995)
国家科技进步奖三等奖：National Science & Technology Progress Award (third class):
全国农业投入产出表及其应用（陈锡康等，1987）
Throwing and producing tables of the nationwide agriculture and applications (Chen Xikang et al., 1987)
数学软件库STYR（徐献瑜、张绮霞等，1987）
Mathematics software base STYR (Xu Xianyu, Zhang Yixia et al., 1987)
三江平原区域农业自然资源遥感复查及其综合治理建议（主要参加者舒光复、顾基发，1988）
Remote sensing reexamination of agricultural resources of Sanjiang Plain and suggestions for comprehensive administration (Shu Guangfu, Gu Jifa as main participants, 1988)
统计软件包SASD（张建中、杨自强等，1989）
Statistics software package SASD (Zhang Jianzhong, Yang Ziqiang et al., 1989)
不稳定试井方法评价油气藏特征研究（主要参加者余其煌、吴声昌等，1991）
Characteristic evaluation of oil and gas resources by unstable well-testing method (Yu Qihuang, Wu Shengchang et al. as main participants, 1991)
长江上游生态环境和社会经济条件研究与评价（主要参加者王毓云，1995）
Studies and evaluation of ecology environment and social economic conditions of upper reaches of the Yangtze River (Wang Yuyun as a main participant, 1995)
中国控制系统计算和辅助设计CADCSC软件系统（韩京清、许可康，1995）
Software system CADCSC of computing and auxiliary design of control systems of China (Han Jingqing, Xu Kekang, 1995)
全国粮食产量预测（陈锡康等，1996）
Grain output forecast of China (Chen Xikang et al., 1996)
引青水利自动化系统工程（主要参加者张永光，1996）
Automation system project of water conservancy drawing the Qing River (Zhang Yongguang as a main participant, 1996)
值分布论及其新研究（杨乐，1997）
Value distribution theory and new development (Yang Le, 1997)
中国国情分析 --- 中国长期发展问题的系统研究（主要参加者陈锡康，1998）
Analysis of national conditions of China (Chen Xikang as a main participant, 1998)
中国科学院科技成果奖一等奖：CAS Science & Technology Achievement Award (first class):
双法在四川、内蒙的推广应用（华罗庚等，1980）
Popularizations and applications of general programming and optimal selection method in Sichuan and Inner Mongolia (Hua Luogeng et al., 1980)
优选节油技术和铁路系统运输统筹（华罗庚等，1980）
Optimal selection technology of saving oil and general programming of railway transportation (Hua Luogeng et al., 1980)
机械化证明（吴文俊，1980）
Mechanization proving (Wu Wenjun, 1980)
全面质量管理的研究应用和推广（刘源张，1980）
Studies, applications and popularizations of total quality management (Liu Yuanzhang, 1980)
系列软件计划（陆汝钤，1981）
A project of series software (Lu Ruqian, 1981)
最优化理论及其应用（越民义、吴方、徐光辉、韩继业等，1981）
The optimization theory and applications (Yue Minyi, Wu Fang, Xu Guanghui, Han Jiye et al., 1981)
统筹法、优选法在规划、经营决策及重大项目的研究与论证中的应用（陈德泉、李之杰、计雷等，1981）
Applications of general programming and optimal selection method to planning, management decision and demonstration of major projects (Chen Dequan, Li Zhijie, Ji Lei et al., 1981)
非线性波孤立子研究（屠规彰、邬华谟、秦孟兆，1981）
Studies on isolators of non-linear waves (Tu Guizhang, Wu Huamo, Qin Mengzhao, 1981)
数论在近似分析中的应用（华罗庚、王元，1983）
Applications of number theory to approximate computing (Hua Luogeng, Wang Yuan, 1983)
中国科学院自然科学奖一等奖：CAS Natural Science Award (first class):
补偿列紧与气动力学方程组（丁夏畦等，1988）
Compensated compactness and the system of equations of gas dynamics (Ding Xiaqi et al., 1988)
有限元外推技术（林群等，1989）
The extrapolation method of the finite element (Lin Qun et al., 1989)
正则边界元方法与自适应边界元方法（余德浩，1989）
The regular boundary element method and adaptive boundary element method (Yu Dehao, 1989)
哈密尔顿系统的辛几何算法（冯康、秦孟兆等，1990）
Symplectic geometric algorithm of Hamiltonian systems (Feng Kang, Qin Mengzhao et al., 1990)
狄氏型与随机分析（马志明、严加安，1992）
Dirichlet forms and stochastic analysis (Ma Zhiming, Yan Jiaan, 1992)
关于斯坦纳树的研究（堵丁柱，1993）
Studies on the Stener tree (Du Dingzhu, 1993)
自适应估计与控制的研究（郭雷、陈翰馥，1994）
Studies on adaptive estimation and control (Guo Lei, Chen Hanfu, 1994)
流形上的极小曲面（王光寅、吉敏，1995）
Minimal surfaces on manifolds (Wang Guangyin, Ji Min, 1995)
几何定理机器证明理论与算法的新进展（高小山，1995）
New development of theory and algorithms of mechanization of geometric theorem proving (Gao Xiaoshan as a main participant, 1995)
多复变数奇异积分（主要参加者孙继广，1996）
Singular integrals of several complex variables (Sun Jiguang as a main participant, 1996)
有限域上典型群的几何学及其应用（万哲先，1997）
Geometry of classical groups over finite fields and applications (Wan Zhexian, 1997)
流体运动的扩散抛物化理论、方程和数值方法（主要参加者王汝权，1997）
The theory, equations and numerical method of parabolized proliferation of fluid movement (Wang Ruquan as a main participant, 1997)
多复变与李群（周向宇，1999）
Function theory of several complex variables and Lie groups (Zhou Xiangyu, 1999)
多复变数几何函数论（主要参加者余其煌、王世坤，2000）
Geometric function theory of several complex variables (Yu Qihuang, Wang Shikun as main participants, 2000)
向量优化中的变分模型与集值分析（陈光亚、汪寿阳，2001）
Variational models and set-valued analysis in vector optimization (Chen Guangya, Wang Shouyang, 2001)
中国科学院科技进步奖特等奖：CAS Science & Technology Progress Award (special class):
黄淮海平原农业时空开发配置模型（主要参加者王毓云，1987）
Disposition model of agricultural time and space developing of Huang-Huai-Hai Plain (Wang Yuyun as a main participant, 1987)
中国科学院科技进步奖一等奖：CAS Science & Technology Progress Award (first class):
非线性移位寄存器（万哲先等，1986）
Non-linear shift registers (Wan Zhexian et al., 1986)
地震勘探数值方法（冯康、张关泉等，1986）
Numerical methods of seismic prospecting (Feng Kang, Zhang Guanquan et al., 1986)
数学软件库STYR（徐献瑜、张绮霞等，1986）
Mathematics software base STYR (Xu Xianyu, Zhang Yixia et al., 1986)
通用有限元程序系统（崔俊芝等，1986）
General-purpose finite element program system (Cui Junzhi et al., 1986)
广义特征值问题的扰动理论（孙继广，1986）
Disturbance theory of the generalized eigenvalue problem (Sun Jiguang, 1986)
有限元理论及方法（石钟慈，1987）
The finite element theory and methods (Shi Zhongci, 1987)
量子场论大范围性质的研究（主要参加者王世坤，1987）
Studies on the global properties of quantum field theory (Wang Shikun as a main participant, 1987)
统计软件包SASD（张建中、杨自强等，1988）
Statistics software package SASD (Zhang Jianzhong, Yang Ziqiang et al., 1988)
不稳定试井方法评价油藏特征研究（余其煌、吴声昌等，1990）
Characteristic evaluation of oil and gas resources by unstable well-testing method (Yu Qihuang, Wu Shengchang et al. as main participants, 1990)
黄淮海平原区域综合治理技术和农业发展战略研究（主要参加者王毓云，1991）
Comprehensive administration method and strategy research for agricultural development of Huang-Huai-Hai Plain (Wang Yuyun as a main
participant, 1991)
天马专家系统开发环境（陆汝钤，1992）
"Heaven Steed" --- An expert system development environment (Lu Ruqian, 1992)
全国粮食产量预测研究（陈锡康等，1992）
Studies on the grain output forecast of China (Chen Xikang et al., 1992)
长江上游生态环境和社会经济条件的研究与评价（主要参加者王毓云，1992）
Studies and evaluation of ecology environment and social economic conditions of upper reaches of the Yangtze River (Wang Yuyun as a main participant, 1992)
陈嘉庚奖：Chen Jiageng Award:
华罗庚、王元（1990） 吴文俊（1993） 杨乐（1998）
Hua Luogeng & Wang Yuan (1990) Wu Wenjun (1993) Yang Le (1998)
求是基金会杰出科学家奖：Outstanding Scientist Award of Qiushi Fund:
吴文俊（1994） Wu Wenjun (1994)
何梁何利基金科技进步奖：Science & Technology Progress Award of He-Liang-He-Li Fund:
陈景润（1994）王元（1994）杨乐（1998）马志明（1999）丁夏畦（2000）石钟慈（2000）陆启铿（2001）
Chen Jingrun (1994)Wang Yuan (1994)Yang Le (1998)Ma Zhiming (1999)Ding Xiaqi (2000)Shi Zhongci (2000)Lu Qikeng (2001)
中国青年科学家奖：Young Scientist Award of China:
堵丁柱（1992） 郭雷（1994） 袁亚湘（1996）
Du Dingzhu(1992) Guo Lei(1994) Yuan Yaxiang(1996)
中国青年科技奖：Young Science & Technology Award of China:
郭雷（1990） 汪寿阳（1994） 张立群（2004）
Guo Lei(1990) Wang Shouyang(1994) Zhang Liqun(2004)
陈志明（2006） 洪奕光（2006） 杨晓光（2006)
Chen Zhiming(2006) Hong Yiguang(2006) Yang Xiaoguang(2006)
重要的国际奖名单：A partial list of important international awards:
第三世界科学院数学奖（吴文俊，1992）
Mathematics Award of the Third World Academy of Sciences (Wu Wenjun, 1992)
马普研究奖（马志明等，1992）
Max-Planck Research Award（ Albeverio、Zhiming Ma、Roeckner, 1992）
国际自动控制联合会青年作者奖（郭雷，1993）(洪奕光，1999)
IFAC Young Author Prize (Guo Lei, 1993)
印度Hardy-Ramanujian学会杰出奖（贾朝华，1995）
Outstanding Prize of the Hardy-Ramanujian Society of India (Jia Chaohua, 1995)
国际IFORS运筹学进展奖一等奖（章祥荪、崔晋川，1996）
IFORS Prize for Operational Research in Development (first class) (Zhang Xiangsun, Cui Jinchuan, 1996)
Herbrand自动推理成就奖（吴文俊，1997）
Herbrand Award for Distinguished Contributions to Automatic Reasoning (Wu Wenjun, 1997)
德国洪堡基金会洪堡研究奖(朱力行, 1998)
The Humboldt Research Award of The Alexander-von Humboldt Foundation of Germany(Zhu, Lixing, 1998)
国际IFORS运筹学进展奖一等奖（陈锡康等，1999）
IFORS Prize for Operational Research in Development (first class) (Chen Xikang et al., 1999)
国际自动控制联合会青年作者奖（洪奕光，1999）
IFAC Young Author Prize (Hong Yiguang, 1999)
哈灵顿•石川质量专家奖（刘源张，2000）
Harrington-Ishkawa Award（Liu Yuanzhang，2000）
国际具有影响力的经典引文奖（陈光亚，2000）
Citation Classic Award (Chen Guangya, 2000)
捷克科学院"数学科学成就"荣誉奖（林群，2001）
Mathematical Science Achievement Award by Czech Academy (Lin Qun，2001)
两院院士
研究院现有中国科学院院士17人，中国工程院院士2人。
中国科学院院士：吴文俊、王元、杨乐、陆启铿、丁夏畦、万哲先、石钟慈、林群、陈翰馥、马志明、丁伟岳、严加安、陆汝钤、李邦河、郭雷、席南华、袁亚湘；
中国工程院院士：崔俊芝、刘源张。
已去世的院士有：华罗庚、张宗燧、冯康、关肇直、陈景润、许国志。
此外，曾经在数学所工作过，后来当选为院士的有：苏步青、陈建功、段学复、庄逢甘、胡世华、戴元本、胡海昌、胡和生、宋健、夏培肃、唐稚松。
学术交流
从1956年起，数学研究所就通过举办培训班、讲习班、接待进修教师等方式，密切了与国内高等院校的交流合作。来自高等院校的许多数学工作者受益匪浅，后来都成为各自领域的学术骨干。当时的国际合作交流，主要限于社会主义国家。1978年改革开放以后，大批科研人员走出国门，与国际同行开展了广泛的交流。
1985年，在王元所长等人的积极倡导和推动下，数学研究所成为科学院第一批开放研究所，稍后其他三所也建立了有关的开放实验室，贯彻"开放、流动、联合、面向全国、面向世界"的方针，大规模地接待国内外访问学者。
在最近三年中，科研人员应邀出访719人次，接待国内外来访1055人次（其中海外学者604位，国内学者451位）。1999--2001年，研究院主办或与其他单位共同主办了25次重要的国际学术会议或研讨会。常年举办的学术讨论班有70多个。
研究生培养
数学研究所一贯有尊师重教、甘当人梯的优良传统，把培养人才放在十分重要的地位。所内还曾设立鼓励青年学者相互切磋的"练拳园地"。
1956年，数学所招收了第一批研究生。但"文革"前招收的研究生总数不足20人。
1978年我国恢复研究生制度，数学所从1500余名考生中择优录取了24名硕士研究生。从此，人才的培养走向制度化，被评为科学院博士生重点培养基地。
1978年以来培养硕士近千人，博士500余人，博士后100余人。一批杰出的青年数学家脱颖而出，有3人当选为中国科学院院士，2人被评为中国十大杰出青年，2人获中国青年科学家奖，1人获全国五四青年奖章，3人担任"973"首席科学家，20人获国家杰出青年基金，8人获香港"求是"杰出青年学者奖，10人获中国科学院青年科学家奖一等奖，17人获得"百人计划"支持。
校友会
自1978年我国恢复研究生制度以来，数学与系统科学研究院已培养硕士和博士各千余人，博士后300余人，可谓桃李满天下。为了进一步凝聚校友力量，促进数学与系统科学研究院发展，研究院领导决定筹备成立校友会。校友会宗旨是“服务海内外校友，促进数学院发展。”目前筹备工作正处于第一阶段，即校友工作开局和夯实基础的阶段。将通过追寻校友、建立并完善校友数据库、创建校友网来构建“一库、一网”的沟通联络框架，这是开展校友工作的基本思路，也是校友工作的重要内容。根据筹备工作的进行程度，将在适当时间正式成立校友会，同时在民政部门登记备案。欢迎广大校友积极参与校友会筹备工作，为数学与系统科学院的发展贡献力量。
